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Offre d’Emploi

Ingénieur (micro)mécanique et Procédé de fabrication

En collaboration avec des physiciens du CNRS, ADELIS développe une nouvelle technique d’analyse de l’ADN en capillaire, qui permet de concentrer et de mesurer rapidement la taille de quantités infimes d’ADN.

La mission générale du poste est de concevoir et développer des dispositifs d’analyse biologique basés sur un assemblage de capillaires de silice. Le développement du procédé de fabrication fait partie du développement des dispositifs.

Plus spécifiquement, vous aurez à :

1. Développer les procédés de fabrication et de contrôle des dispositifs consommables de la société, les industrialiser, en assurer l’amélioration continue.
2. Maquetter puis développer des nouveaux dispositifs ou des bancs d’essais, en collaborant avec les ressources internes en instrumentation et en chimie analytique, et en respectant les procédures de développement de l’entreprise.
3. Expérimenter pour valider les prototypes
4. Documenter vos travaux de conception et expérimentaux
5. Entretenir des relations saines et fructueuses avec les laboratoires partenaires et les fournisseurs, pour l’amélioration de la fabrication, l’exploration de nouvelles applications, et la conduite de prestations spécifiques.
6. Assurer l’expertise de la société en conception mécanique et en fabrication. Maintenir les outils de CAO et de fabrication de la société en adéquation avec les besoins.

Profil : Bac+5 en mécanique générale ou micromécanique, école d’ingénieur ou université, avec une formation ou une expérience sur la fabrication de dispositifs consommables de petites dimensions (collages, matériaux, plasturgie, étirement de fibres…) CAO 3D. Une expérience en microfluidique, en fabrication de capillaires ou de fibres optiques, ou en instrumentation/automatique sont des atouts supplémentaires. Rigueur méthodologique pour la modélisation et pour l’expérimentation. Esprit d’initiative pour le développement des prototypes et des procédés de fabrication. Qualités relationnelles et rédactionnelles. Anglais courant.

Nature du poste : CDI, dès que possible

Contact : Frédéric Ginot fginot@adelis-tech.com

µLAS: Sizing of expanded trinucleotide repeats with femtomolar sensitivity in less than 5 minutes

Huntington’s Disease and µLAS Technology

Communiqué de Presse du CNRS

BIABOOSTER : un dispositif plus sensible pour caractériser l’ADN en circulation dans le sang

Développée et brevetée¹ en 2012 et 2014 au Laboratoire d’analyse et d’architecture des systèmes (LAAS-CNRS) et mise en œuvre industriellement par Picometrics-Technologies, la technologie du BIAbooster permet de caractériser l’ADN avec une précision et une sensibilité inédites. Appliquée à l’analyse de l’ADN résiduel circulant dans le sang, elle a permis d’identifier des signatures prometteuses pour le suivi de patients atteints de cancer. Ces signatures, présentées dans le numéro du 20 mars 2018 d’Analytical Chemistry, pourraient être confirmées par une étude de plus grande ampleur menée par des équipes de l’Université Paris Descartes, de l’Inserm, de l’AP-HM et de l’AP-HP (Hôpital européen Georges-Pompidou).

Dans le corps humain, la mort occasionnelle de cellules se traduit par la dégradation et le relargage de leur ADN, qui circule alors dans le sang, avant d’être éliminé. Des études antérieures ont montré que les patients atteints de cancer présentaient des taux élevés de fragments d’ADN en circulation dans le sang. Cependant, des facteurs comme une alimentation riche ou un effort physique peuvent également être responsables de ce taux élevé de fragments d’ADN. L’analyse sensible et rapide permise par le dispositif BIABooster des molécules d’ADN ouvre de nouvelles voies pour mieux caractériser la composition de cette fraction résiduelle dans le sang et ainsi préciser son origine.

Afin d’analyser l’ADN, le dispositif BiaBooster opère en deux étapes de concentration et de séparation réalisées en ligne². D’abord, l’ADN est concentré via un système de capillaires formé de la jonction d’un petit capillaire et d’un autre de plus grande section. Les chercheurs font couler une solution contenant de l’ADN dans le grand capillaire et utilisent un champ électrique de faible amplitude pour ralentir la migration. Le changement de vitesse d’écoulement et de champ électrique au niveau de la constriction permet d’arrêter l’ADN et de le concentrer comme une « galette ». Cette galette est ensuite libérée par la baisse progressive du champ électrique, ce qui permet également d’effectuer l’opération de séparation en fonction de la taille des fragments.

Depuis 2016, les chercheurs ont exploité le BIABooster et arrêté un protocole présenté dans Analytical Chemistry. En une vingtaine de minutes, l’outil permet la détection d’ADN jusqu’à une concentration de 10 fg/µl³. Il permet de déterminer la concentration et la taille d’un échantillon avec, respectivement, des précisions de 20 % et 3 %. Il s’est révélé particulièrement adapté pour dresser le profil de l’ADN en circulation dans le sang pour des volontaires sains ou des patients atteints de cancer, à la fois en terme de concentration et de profil de taille.

Au-delà de la prouesse technique, les chercheurs ont décidé d’utiliser ce dispositif pour analyser une centaine d’échantillons cliniques de patients atteints de cancer provenant de l‘hôpital européen Georges-Pompidou AP-HP et des hôpitaux de l’AP-HM.  Leurs premiers résultats confirment que la présence d’ADN de faible poids moléculaire en quantité importante pourrait constituer une information clinique pertinente pour le suivi des patients. Ils devront être confirmés par une étude de plus grande ampleur menée par des équipes de l’Université Paris Descartes, l’Inserm, l’AP-HM et l’AP-HP (Hôpital européen Georges-Pompidou).

http://www2.cnrs.fr/presse/communique/5509.htm

“BIABooster: On-line DNA Concentration and Size Profiling with a Limit of Detection of 10 fg/µL and Application to High-Sensitivity Characterization of Circulating Cell-Free DNA”

New article published in Analytical Chemistry:

Abstract: We describe a technology to perform sizing and concentration analysis of double stranded DNA with a sensitivity of 10 fg/µL in an operating time of 20 minutes. The technology is operated automatically on a commercial capillary electrophoresis instrument using electro-hydrodynamic actuation. It relies on a new capillary device that achieves on-line concentration of DNA at the junction between two capillaries of different diameters, thanks to viscoelastic lift forces. Using a set of DNA ladders in the range 100-1500 bp, we report a sizing accuracy and precision better than 3%, and a concentration quantification precision of ~20%. When the technology is applied to the analysis of clinical samples of circulating cell-free DNA (cfDNA), the measured cfDNA concentrations are in good correlation with those measured by digital PCR. Furthermore, the cfDNA size profiles indicate that the fraction of low molecular weight cfDNA in the range 75-240 bp is a candidate biomarker to discriminate between healthy subjects and cancer patients. We conclude that our technology is efficient in analyzing highly diluted DNA samples and suggest that it will be helpful in translational and clinical researches involving cfDNA.

MSB 2018, February 18-21, Rio de Janeiro – Brazil

Attend Prof François Couderc’s oral presentation (Université Toulouse III – Paul Sabatier, France) on the following topic:

CBQCA labelling of Trp, Leu, Ile and Ser, Difficulties and Solutions in Studies using CE-LEDIF

34^th International Symposium on Microscale Separations and Bioanalysis 

http://www.msb2018.org

CNAPS 2017, September 20-22, Montpellier-France

Join us at the 10^th International Symposium on Circulating Nucleic Acids in Plasma and Serum.

Application to Cancer detection:

Circulating cell free DNA (ccfDNA) is being explored as a diagnostic and prognostic tool for various diseases, especially cancer. Beyond evaluation of DNA mutational status, its blood concentration as well as its fragmentation profile has been investigated in many studies as potential cancer biomarkers. Contradictory results have however been described.

Picometrics and its partner Paris-Descartes University will present new methods for the characterization and analysis of plasma cell free DNA concentration and integrity using  the new BIABooster system based on in-line DNA concentration, as well as newly developed dedicated droplet-based digital PCR assays (dPCR). BIABooster analyses give DNA concentration and size profile in a single operation, using only 1 µl of sample.

http://www.cnaps2017.com

BIOMARKER DAYS, 14-15 Juin 2017, Montpellier-France

Picometrics Technologies présentera la technologie µLAS, une technologie innovante de profilage d’ADN circulant, directement à partir du plasma.  Ce profilage, qui donne la concentration et le profil de taille de l’ADN circulant, a le potentiel de devenir un biomarker de monitoring de traitement en oncologie.

La technique va bien au-delà de ce que peuvent faire les analyseurs classiques d’ADN. Un profil de taille complet et quantitatif est donné quelle que soit la concentration de l’échantillon.

Session : Mercredi 14 Juin  Les solutions technologiques au service du développement des biomarqueurs :

“Surveillance clinique dynamique par la technologie µLAS : mesure rapide de la concentration et du profil de taille des ADN libres circulants”

http://www.eurobiomed.org

cfDNA 2017, April 6-7, Copenhagen

Picometrics is pleased to announce its partnership with IdSolutions and invites you to visit IdSolutions Booth # K at the 3rd International Meeting on Cell-Free DNA, Copenhagen, Denmark.

Come and discover our cfDNA Analysis Services based on proprietary BIABooster technology with unrivalled sensitivity.

www.cfdna2017.eu

MSB2017, March 26-29, The Netherlands