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Characterization of plasma cell-free DNA integrity using BIABooster system

[…] Recently, using a novel technology (BIABooster system) based on electro-hydrodynamic actuation, we also suggested the pertinence of total ccfDNA quantification and size profiling for several cancers including melanoma, CRC, non-small cell lung cancer (NSCLC) and prostate cancer […].

READ the original research article: Characterization of Plasma Cell-Free DNA Integrity Using Droplet-Based Digital PCR: Toward the Development of Circulating Tumor DNA-Dedicated Assays.

Front. Oncol., 06 May 2021 | https://doi.org/10.3389/fonc.2021.639675

OFFRE D’EMPLOI

Technicien(ne) de Laboratoire

CDD de 6 mois à compter du 01/03/2021

Nous recherchons un(e) Technicien(ne) de Laboratoire pour consolider notre application sur l’ADN circulant dans le plasma sanguin comme biomarqueur pour le suivi des thérapies et des patients atteints de cancer et pour notre activité de service. Cette activité est basée sur une technologie innovante de mesure de la taille d’un échantillon d’ADN.

• Descriptif du poste : Sous la direction du Responsable du Service Analytique, vous aurez à : réaliser les expériences convenues, interpréter les résultats, proposer des améliorations, participer à la rédaction des rapports d’études pour la R&D en fonction des travaux réalisés. Réaliser des analyses d’échantillons externes et rédiger des rapports d’analyses. Participer à la gestion du laboratoire et à la maintenance des équipements.
• Description du profil : Bac+2 à Bac+4 en chimie analytique ou biochimie. Une expérience en biologie moléculaire ou en électrophorèse capillaire serait un plus.
• Qualités : Sens de l’observation. Rigueur expérimentale. Prise d’initiative pour l’atteinte des objectifs. Aisance dans l’utilisation de l’informatique.
• Expérience minimale dans le poste : Minimum 1 an
• Localisation du poste : Labège – 31

ADELIS parmi les PME françaises lauréates du “Challenge international COVID-19”

Communiqué de presse de bpifrance, 23 septembre 2020

Challenge international COVID-19 : 8 startups et PME françaises innovantes lauréates de l’appel à projets EUREKA

Paris, le 23 septembre 2020 – A la suite d’un appel à projets ouvert du 15 avril au 15 mai 2020, via le réseau intergouvernemental EUREKA, 8 startups innovantes françaises sont lauréates du « Challenge international Covid-19 ». Financé par le Canada, l’Espagne, le Danemark, l’Autriche, la Turquie, les Pays-Bas et la France, ce programme vise à accompagner et soutenir les partenariats technologiques internationaux dont les projets de R&D proposent des solutions de pointe rapidement déployables face aux défis liés au Covid-19. 
 
Le Challenge international Covid-19 est un dispositif créé à l’initiative du Conseil National de Recherches Canada (CNRC), visant à soutenir et financer des partenariats technologiques entre entreprises innovantes de différents pays qui souhaitent adapter ou développer une solution pouvant limiter ou réduire l’impact de la crise du coronavirus. Les organismes finançant l’innovation au sein de sept pays[1], dont Bpifrance pour la France, se sont mobilisés pour trouver des synergies et accélérer les projets dans le cadre de ce programme, qui met en exergue les bénéfices d’une collaboration internationale dans l’innovation.
 
L’appel à projets, ouvert en plein cœur de la pandémie, a reçu plus de 60 candidatures à l’échelle globale, dont 12 impliquant des entreprises françaises. Après instruction par les différentes agences d’innovation à l’origine de ce challenge, 8 startups et PME françaises ont été déclarées lauréates et seront ainsi accompagnées et financées pour mener à bien leurs projets collaboratifs internationaux.
Les entreprises françaises et leurs partenaires étrangers ont été sélectionnés suivant des critères évaluant la pertinence et la viabilité de leur projet, mais également leur capacité à développer rapidement leurs solutions : en effet, le dispositif ciblait des projets d’une durée de développement de 3 à 12 mois maximum, avec un lancement sur le marché au bout de 6 mois à l’issue du développement produit.
 
Les lauréats français répondent à trois problématiques actuelles et concrètes :

• Développer des équipements médicaux spécifiques pour soigner les malades du Covid-19 et réduire la saturation des services de santé ;
• Faciliter le diagnostic et le développement de vaccins viraux afin de proposer une solution de longue durée face à la crise sanitaire ;

Sécuriser les espaces de travail et garantir la relance économique avec des dispositifs qui assurent à la fois le maintien de la production des entreprises et la distanciation sociale nécessaire au sein des sites industriels et des bureaux. 

Bpifrance : https://presse.bpifrance.fr/challenge-international-covid-19-8-startups-et-pme-francaises-innovantes-laureates-de-lappel-a-projets-eureka/

MSB 2020 postponed to September 27-30, in virtual format

Attend the virtual edition with the presentation on « Concentration and Separation of DNA in complex biological fluids with µLAS technology ».

www.msb2020.com

MSB 2020, April 5-8, Saint-Malo, France

Join us at the 36^th International Symposium on Microscale Separations and Bioanalysis and attend our presentation on “Concentration and separation of DNA in complex biological fluids with µLAS technology”.

www.msb2020.com

ITP 2019, September 1-4, Toulouse-France

Join us at the 26^th International Symposium on Electroseparation and Liquid Phase-Separation Techniques and discover the disruptive µLAS technology for DNA analysis.

https://www.itp2019.com/

µLAS: Sizing of expanded trinucleotide repeats with femtomolar sensitivity in less than 5 minutes

Huntington’s Disease and µLAS Technology

Communiqué de Presse du CNRS

BIABOOSTER : un dispositif plus sensible pour caractériser l’ADN en circulation dans le sang

Développée et brevetée¹ en 2012 et 2014 au Laboratoire d’analyse et d’architecture des systèmes (LAAS-CNRS) et mise en œuvre industriellement par Picometrics-Technologies, la technologie du BIAbooster permet de caractériser l’ADN avec une précision et une sensibilité inédites. Appliquée à l’analyse de l’ADN résiduel circulant dans le sang, elle a permis d’identifier des signatures prometteuses pour le suivi de patients atteints de cancer. Ces signatures, présentées dans le numéro du 20 mars 2018 d’Analytical Chemistry, pourraient être confirmées par une étude de plus grande ampleur menée par des équipes de l’Université Paris Descartes, de l’Inserm, de l’AP-HM et de l’AP-HP (Hôpital européen Georges-Pompidou).

Dans le corps humain, la mort occasionnelle de cellules se traduit par la dégradation et le relargage de leur ADN, qui circule alors dans le sang, avant d’être éliminé. Des études antérieures ont montré que les patients atteints de cancer présentaient des taux élevés de fragments d’ADN en circulation dans le sang. Cependant, des facteurs comme une alimentation riche ou un effort physique peuvent également être responsables de ce taux élevé de fragments d’ADN. L’analyse sensible et rapide permise par le dispositif BIABooster des molécules d’ADN ouvre de nouvelles voies pour mieux caractériser la composition de cette fraction résiduelle dans le sang et ainsi préciser son origine.

Afin d’analyser l’ADN, le dispositif BiaBooster opère en deux étapes de concentration et de séparation réalisées en ligne². D’abord, l’ADN est concentré via un système de capillaires formé de la jonction d’un petit capillaire et d’un autre de plus grande section. Les chercheurs font couler une solution contenant de l’ADN dans le grand capillaire et utilisent un champ électrique de faible amplitude pour ralentir la migration. Le changement de vitesse d’écoulement et de champ électrique au niveau de la constriction permet d’arrêter l’ADN et de le concentrer comme une « galette ». Cette galette est ensuite libérée par la baisse progressive du champ électrique, ce qui permet également d’effectuer l’opération de séparation en fonction de la taille des fragments.

Depuis 2016, les chercheurs ont exploité le BIABooster et arrêté un protocole présenté dans Analytical Chemistry. En une vingtaine de minutes, l’outil permet la détection d’ADN jusqu’à une concentration de 10 fg/µl³. Il permet de déterminer la concentration et la taille d’un échantillon avec, respectivement, des précisions de 20 % et 3 %. Il s’est révélé particulièrement adapté pour dresser le profil de l’ADN en circulation dans le sang pour des volontaires sains ou des patients atteints de cancer, à la fois en terme de concentration et de profil de taille.

Au-delà de la prouesse technique, les chercheurs ont décidé d’utiliser ce dispositif pour analyser une centaine d’échantillons cliniques de patients atteints de cancer provenant de l‘hôpital européen Georges-Pompidou AP-HP et des hôpitaux de l’AP-HM.  Leurs premiers résultats confirment que la présence d’ADN de faible poids moléculaire en quantité importante pourrait constituer une information clinique pertinente pour le suivi des patients. Ils devront être confirmés par une étude de plus grande ampleur menée par des équipes de l’Université Paris Descartes, l’Inserm, l’AP-HM et l’AP-HP (Hôpital européen Georges-Pompidou).

http://www2.cnrs.fr/presse/communique/5509.htm

“BIABooster: On-line DNA Concentration and Size Profiling with a Limit of Detection of 10 fg/µL and Application to High-Sensitivity Characterization of Circulating Cell-Free DNA”

New article published in Analytical Chemistry:

Abstract: We describe a technology to perform sizing and concentration analysis of double stranded DNA with a sensitivity of 10 fg/µL in an operating time of 20 minutes. The technology is operated automatically on a commercial capillary electrophoresis instrument using electro-hydrodynamic actuation. It relies on a new capillary device that achieves on-line concentration of DNA at the junction between two capillaries of different diameters, thanks to viscoelastic lift forces. Using a set of DNA ladders in the range 100-1500 bp, we report a sizing accuracy and precision better than 3%, and a concentration quantification precision of ~20%. When the technology is applied to the analysis of clinical samples of circulating cell-free DNA (cfDNA), the measured cfDNA concentrations are in good correlation with those measured by digital PCR. Furthermore, the cfDNA size profiles indicate that the fraction of low molecular weight cfDNA in the range 75-240 bp is a candidate biomarker to discriminate between healthy subjects and cancer patients. We conclude that our technology is efficient in analyzing highly diluted DNA samples and suggest that it will be helpful in translational and clinical researches involving cfDNA.